지베이스 등, 에이프로젠 지분 84.98% 유지·계약 비율 16.04%로 축소

코스피 상장 제약사 에이프로젠(007460)의 최대주주 (주)지베이스는 10월 8일 주식등의 대량보유상황보고서(변경)를 제출하고, 특별관계자와 합산해 에이프로젠 주식등 9741만 334주(84.98%)를 보유하고 있다고 보고했다. 합산 보유주식등의 수와 비율은 직전 보고와 같으며, 이 중 주권(의결권 있는 주식)은 844만 5081주(32.92%)다.

보고사유는 특별관계자 보유 전환사채 계약 변경으로, '주요계약체결 주식등'의 수와 비율은 직전 보고 2492만 1900주(21.74%)에서 1838만 1537주(16.04%)로 654만 363주(5.70%포인트) 줄었다. 이번 보고는 지베이스가 특별관계자와 연명으로 제출했다.

보고자 측 합산 지분 가운데 지베이스 본인 보유분은 주권 525만 4476주(4.58%)이며 나머지는 특별관계자 보유분이다. 계열사 (주)앱토크롬이 전환사채 형태로 6934만 1619주(60.50%)를 보유해 가장 많다.

그 외 특별관계자는 제이드신기술조합제79호 1152만 7699주(10.05%), (주)엔투텍 684만 3849주(5.97%), (주)넥스코닉스 176만 4694주(1.54%), 에이프로젠파마 125만 2086주(1.09%) 순으로 보유하고 있다. 개인 특별관계자는 김재섭 88만 8533주(0.78%), 박미령 44만 9271주(0.39%), 김정출 7만 4895주(0.07%), 강선주 1만 3212주(0.01%)다.

이번 보고서에 기재된 주요계약은 연번 기준 14건, 합계 1838만 1537주(16.04%)다. 이 중 지베이스가 채무자인 7건은 보유 주식을 담보로 제공한 담보계약으로 (주)투파스·에이프로젠아이앤씨(주)·(주)에이프로젠바이오로직스·블루케이대부·(주)온리홀딩스대부·(주)제이와이케이홀딩스가 상대방이다.

특별관계자 중 앱토크롬은 보유 전환사채 가운데 223만 7136주 상당분은 임정연, 447만 4272주 상당분은 (주)투파스, 453만 3091주 상당분은 (주)하베스트로즈와 전환사채양수도계약을 맺고 있으며, 이 중 임정연·투파스와의 계약은 9월 30일 체결(변경)됐다.

제이드신기술조합제79호는 전환사채 90만 2119주·45만 1059주 상당분을 놓고 각각 변창규·권은자와 전환사채 매매 계약을 맺었고, 넥스코닉스는 보유 주식 16만 4000주를 수원지방법원 성남지원에 납세담보로 공탁했다.

지베이스의 담보계약 중 대출금액이 공개된 7건의 합계는 493억원이며 이자율은 4.0~6.5%다. 가장 규모가 큰 계약은 지베이스가 김재섭 보유분을 포함한 236만 4421주를 담보로 계열사 에이프로젠바이오로직스로부터 372억원을 빌린 건이다.

보유목적은 '경영권 영향'이며, 보고자는 회사의 업무집행과 관련한 사항이 발생하면 관계법령 등에서 허용하는 범위와 방법에 따라 주주로서 권리를 행사할 예정이라고 밝혔다.

최근 시장 조회 자료에 따르면 에이프로젠은 연결 기준 최근 4개 분기(2025년 3분기~2026년 2분기) 매출액이 약 1389억원, 영업손실이 약 923억원, 순손실이 약 1386억원이다.

공시에 따르면 지베이스는 2025년 말 기준 자산총액 774억 2600만원, 부채총액 1234억 3900만원으로 자본총액이 -460억 1300만원에 이르는 자본잠식 상태다. 특별관계자인 에이프로젠파마도 자본총액이 -481억 8500만원으로 완전자본잠식 상태다.

10월 7일 기준 공매도 거래비중은 1.99%(1만 2298주)로 최근 20거래일 평균 7.67%보다 낮았다. 신용융자 잔고는 10월 2일 기준 5380주로 발행주식 대비 0.02% 수준이다. (출처: 한국투자증권 HTS 조회 자료)

박승호 데이터투자 기자 shpark@datatooza.com